菌種鑒定

細菌鑒定：

16SrDNA：總長1.5kb的序列，其中包含有10個保守區和9個可變區域（高變區）（如圖1）。其中保守區為所有細菌共有，細菌間無差別，反映物種的親緣關系；可變區具有屬或種的特異性，序列隨菌間親緣關系不同有一定的差異。本公司可通過對16SrDNA全長或其中的部分可變區域進行測序，利用測序結果比對相似度來確定細菌的種類。

 

 

圖1. 細菌16s rRNA

 

真菌鑒定：

ITS（Internal Transcribed Spacer）：5.8S rDNA 和 28S rDNA 基因間隔序列，可用于不同真菌種、屬的分類鑒定。核糖體DNA中的18S、5.8S和28S的基因組序列在大多數生物中趨于保守，在生物種間變化??；而內轉錄間隔區ITS1 和ITS2作為非編碼區（如圖2），承受的選擇壓力較小，相對變化較大，并且能夠提供詳盡的系統學分析所需要的可遺傳性狀。

 

 

 

圖2. 真菌ITS

 

菌種鑒定應用范圍：

 

 

項目流程：

 

 

服務特色：

1.對革蘭氏陽性細菌和酵母有簡便易行的破壁方法，可快速得到擴增模板；

2.使用公司自主研發的比對軟件，快速準確的進行數據比對，縮短項目周期；

3.提供電泳膠圖；

4.提供實驗流程相關數據。

5.從收樣到系統進化樹全線打通，技術服務一步到位。

6.提供blast比對結果

 

結果示例：系統發育樹示例：

 

 

 

送樣要求及訂單：微生物菌種鑒定訂單 下載

 

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