雜種鑒定
產品概述
對多對微衛星引物進行篩選,選取少量樣品,先合成M13接頭引物序列對引物進行試驗,篩選出多態性好,引物效率高的引物。根據選取的高效率的引物設計引物組合方案,合成熒光引物進行雜種鑒定實驗,雜種鑒定是根據不同樣品用相同引物擴增,通過位點信息判斷不同樣品的差異性或者親本分析。
技術流程
可提供的服務
(1)基因組DNA提取、擴增、毛細管電泳檢測
(2)按照您實驗的要求,為您設計實驗方案。包括:熒光標記的選擇,M13接頭引物、實驗條件摸索,內標的選用等等。
(3)合成熒光引物和接頭引物
(4)根據所設計的實驗方案用引物完成PCR擴增
(5)M13-SSR技術結合了SSR與熒光檢測優點,M13具有通用性成本相對較低。
(6)GeneMarker軟件對收集到的數據進行初步處理分析 , 片段大小的精確分析和等位基因判讀解析列到Excel表格中,為您下一步進行關聯分析或連鎖分析等遺傳分析提供數據可靠的數據
技術優勢
(1)成熟的技術平臺:美國應用生物系統公司ABI 3130XL基因分析儀、GeneMarker分析軟件;
(2)多重檢測:如果您研究的位點較多,為了節約您的成本,我們一個泳道可以同時檢測3-5種不同的熒光;
(3)周期短:散樣一般是從實驗室收到訂單時起,檢測上機只需48小時即可收到結果, 提供審核復檢;
送樣要求
(1)基因組DNA:濃度20-30ng/ul以上,OD260/280在1.7-2.1左右,電泳有基因組主帶,需冰袋運輸,需要本公司提取基因組,需要闡明特殊樣品類型,如多糖多酚樣品
(2)可處理的樣本類型
動植物組織 |
500mg以上,需低溫運輸 |
血液(抗凝血) |
>1ml,需低溫運輸 |
細胞: |
大于106,收集細胞沉淀,需干冰運輸 |
土壤 |
干、濕均可,干土壤效果比較好,質量大于5g |
石蠟切片: |
10*10*8um的切片不少于10片,需常溫運輸 |
檢測結果
(1)ABI3730XL電泳的原始文件(fsa格式)和分析文件
(2)每個樣品孔樣品毛細管電泳峰圖(JPG格式)
(3)按位點導出峰圖、EXCEL (位點信息表,峰值高度,峰值大小,峰值面積,等位基因數,0-1矩陣)
(4)聚類分析
(5)實驗報告
結果示例
檢測圖譜
原始數據表
位點信息表
0-1矩陣
聚類分析
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