腫瘤微衛星不穩定(MSI)檢測
產品概述
微衛星是遍布于人類基因組中的短串聯重復序列,微衛星不穩定性(MSI)是指DNA甲基化或者基因突變致錯配修復基因缺失,從而導致微衛星重復序列插入或缺失,繼而長度改變,與腫瘤的發生密切相關。
據文獻報道,大約15%的結直腸癌中存在MSI現象,與無MSI特征的結直腸癌相比,其發病機制、預后和對藥物的敏感性均不同。在非結直腸癌的實體瘤中也存在著不同比例的MSI-H的現象,MSI狀態不同的實體瘤對免疫檢查點抑制劑藥物響應率方面有顯著差異。
睿博興科采用熒光PCR-毛細管電泳法檢測MSI狀態是目前國際公認的金標準,NCCN、ASCO等國際知名機構聯合推薦。同時提取同一患者正常組織和腫瘤組織DNA,采用多重熒光PCR技術對檢測位點進行擴增,再通過毛細管電泳對擴增產物進行檢測,最后利用專業軟件對兩種組織來源的檢測結果進行比對分析。
技術流程
可提供的服務
(1)基因組DNA提取、多重PCR擴增、毛細管電泳檢測
(2)按照您實驗的要求,為您設計實驗方案。包括:熒光標記的選擇,實驗條件摸索,內標的選用等等。
(3)合成熒光引物
(4)根據所設計的實驗方案用引物完成PCR擴增
(5)GeneMarker軟件對收集到的數據進行初步處理分析,審核數據的質量
技術優勢
(1)成熟的技術平臺:美國應用生物系統公司ABI 3130XL基因分析儀、GeneMarker分析軟件;
(2)多重檢測:一個泳道可以同時檢測3-5種不同的熒光;
(3)周期短:散樣一般是從收到訂單時起,檢測上機只需48小時即可收到結果, 默認僅提供審核復檢;
送樣要求
(1)基因組DNA:濃度20-30ng/ul以上,OD260/280在1.7-2.1左右,需冰袋運輸,需要本公司提取基因組,需要闡明特殊樣品類型。
(2)可處理的樣本類型
動物組織 |
500mg以上,需低溫運輸 |
血液(抗凝血) |
>1ml,需低溫運輸 |
細胞: |
大于106,收集細胞沉淀,需干冰運輸 |
石蠟切片: |
10*10*8um的切片不少于10片,需常溫運輸 |
檢測結果
(1)ABI3730XL電泳的原始文件(fsa格式)和分析文件
(2)每個樣品孔樣品毛細管電泳峰圖(JPG格式)
(3)實驗報告
結果示例
檢測圖譜
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